Em 2006, por iniciativa do zagueiro Roque Júnior, o clube, então uma escolinha de futebol, firmava parceria com as categorias de base do São José, disputando suas primeiras competições oficiais: os campeonatos estaduais sub 15, 17 e 20, nos quais as equipes conseguiram a classificação para a segunda fase.
Os bons resultados logo colocaram o Primeira Camisa em condições de alçar voos mais altos. Por isso, no dia 2 de março de 2007, o clube emancipou-se e inscreveu-se para disputar seus primeiros torneios de forma independente. No ano de sua estreia na Segunda Divisão do Campeonato Paulista, o Primeira Camisa ficou a um passo da classificação, ao terminar a campanha em quinto lugar de seu grupo. Enquanto isso, as categorias de base, mesmo sem conquistar um título, repetiam as boas atuações do ano anterior, classificando-se mais uma vez para a segunda fase.
As cores determinadas como oficiais do clube foram o azul, o branco e o vermelho. Depois de definidas, o Primeira Camisa não demorou a apresentar também o distintivo, representado por um jogador circundado por uma bússola estilizada. A idéia, do designer nepalês Biplav Gautam, responsável pelo escudo, é a de transmitir leveza e arrojo. No começo de 2009, a equipe definiu também seu hino oficial, composto pelo torcedor Nivaldo João de Castro Pandeló.
O uniforme da equipe apresenta algumas versões distintas. Geralmente, o clube entra em campo com camisas e meiões vermelhos, com detalhes em branco, e calções brancos. Porém, não é raro ver o Primeira Camisa atuando todo de vermelho, ou até mesmo com calções azuis. Muitas vezes - por conta das cores do uniforme dos adversários - e atendendo a pedidos dos atletas, a equipe também atuou com camisas e meiões brancos, completando o conjunto com calções vermelhos.
A formiga, mascote do Primeira Camisa, foi herdada do outro clube que representava a cidade de São José dos Campos, o São José. O clube tinha a formiga como sua mascote oficial e era conhecido como "Formigão do Vale". Com a falência do clube em 1976, a mascote ficou sem representar nenhum time até a criação do Primeira Camisa, em 2007. A figura da formiga foi escolhida porque representa trabalho e união.
